在台灣，嬰兒濕紙巾若出現微生物污染，可能引發皮膚刺激與發炎，因此家長與業者必須嚴格把關。依衛福部與TFDA的檢驗標準，必須提供合格檢驗報告，確保無致病菌並控管總菌落數。選購時挑有完整檢驗證明、符合 CNS/國家標準的產品，留意成分表，避免酒精、香精等刺激物。若出現異味、紅腫，應停止使用並向通路或主管機關反映。

在台灣，嬰兒濕巾常含塑膠成分，長期接觸可能刺激嬰兒肌膚並造成環境塑膠微粒累積。專家建議，父母應以成分表為首要判斷，選擇標示不含合成塑料的產品，或以植物纖維與水基配方為主。支持台灣本土品牌、選擇標示「無塑膠聚合物/可生物降解」的產品，並妥善回收包裝。若難以避免，改用清水與棉布擦拭亦是安全替代。此外，政府與消費者團體也在推動更嚴謹的成分公開與包裝回收制度，促使業者朝透明與可持續方向前進。